电子显微镜（Electron Microscope），简称电镜，是以电子束代替光束成像，观察细微结构的电子仪器。1932年由德国的M.诺尔和E.鲁斯卡发明。 电子显微镜由镜筒、真空装置和电源柜三部分组成。按结构和用途可分为透射式电子显微镜、扫描式电子显微镜、反射式电子显微镜和发射式电子显微镜等。其被广泛地应用于物理、化学、生物学、医药卫生、矿物冶金、地质和农业等各个学科。工作原理是在一个高真空系统中，由电子枪发射电子束，穿过被研究的试样，经电子透镜聚焦放大，在荧光屏上显示一放大的像。 电子显微镜比光学显微镜放大率更高。电子显微镜最高的分辨力可达0.07nm。
一种新型的显微镜，使高速电子流通过物体，经过电磁的放大装置，使物体的影像显现在荧光屏上。放大倍数比光学显微镜大得多，一般可达几十万倍。
利用電子透鏡聚焦的電子束代替光束，放大物體影像的裝置。電子束的波長比普遍光短數千倍，波長越短，分辨能力越大，故電子顯微鏡的解像力及放大倍率皆高，能觀察物質極細微的結構形態。已用於研究病毒、蛋白分子和金屬表面。
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